Ep. 1
Tom e Diana, con l'aiuto di Gary Navarro, cercano di rintracciare T.J. Kim, un 4400 la cui abilità parrebbe aver spinto un uomo ad accoltellare Dennis Ryland. Richard e Lily si ritrovano ad avere a che fare con una Isabelle ormai cresciuta.
Ep. 2
Gary Navarro viene arrestato dopo aver tentato di assassinare Dennis Ryland. Isabelle tenta il suicidio nella speranza di salvare sua madre, ma fallisce sopravvivendo a una caduta dal tetto del Centro 4400.
Ep. 3
T.J. Kim viene ucciso e Tom viene accusato dell'omicidio. Shawn e Isabelle si avvicinano.
Ep. 4
Tom e Diana cercano il responsabile di alcuni sequestri di giovani 4400. Shawn è minacciato dal Nova Group.
Ep. 5
In una delle fantasie di Alana, Tom e Alana vedono Maia, anche se non hanno alcun ricordo della sua esistenza. La vita di Diana è in pericolo e Tom fa un patto con gli uomini del futuro per correggere la storia.
Ep. 6
Isabelle vuole vendicarsi del Nova Group dopo il loro attacco a Shawn. Alana affronta l'uomo che ha ucciso suo marito e suo figlio in un incidente d'auto avvenuto 9 anni prima.
Ep. 7
Con l'aiuto di Dennis Ryland, l'NTAC rintraccia gli altri membri del Nova Group. Nikki fa una visita inaspettata a Shawn.
Ep. 8
Tom e Diana assumono un allucinogeno che è stato creato con un olio prodotto dalle mani di un 4400.
Ep. 9
Kevin Burkhoff diventa un bersaglio quando viene scoperta la sua ricerca sulla promicina. Tom e Diana cercano Kevin, ma scoprono fin dove si spingerà per proteggere il suo lavoro. Shawn incontra il suo idolo al Centro 4400.
Ep. 10
L'indagine di Tom e Diana su una serie di orribili omicidi li porta a scoprire un'altra cospirazione all'interno del governo. Al Centro, Shawn riceve in dono da uno dei 4400 la possibilità di vedere il suo futuro.
Ep. 11
L'NTAC e il Centro 4400 collaborano per trovare Jordan Collier. Kyle Baldwin riceve una visita a sorpresa in prigione.
Ep. 12
I membri del Nova Group che erano sotto la custodia dell'NTAC evadono con l'aiuto esterno di Jordan Collier. Diana racconta ad April della sua relazione con Ben. Shawn e Richard scoprono che Isabelle sta lavorando con Dennis Ryland.
Ep. 13
Tom e Diana continuano le loro indagini sul piano di Jordan Collier. Dennis Ryland ritorna all'NTAC. Isabelle rimane gravemente ferita quando prende in ostaggio una classe.
Un film, una serie, un attore o un doppiatore. Oppure una domanda: «chi doppia Woody?»
