Ep. 1
Colui che sfidò il sole
Quando Edward e Alphonse incontrano un capo religioso che sostiene di compiere miracoli, si convincono che possa avere la pietra filosofale.
Ep. 1
Ep. 2
Il corpo di un peccatore
Edward e Alphonse discutono per decidere se rivelare la verità che si nasconde dietro i miracoli di Cornello, rischiando di rovinare la vita degli abitanti della città.
Ep. 3
Mamma...
Ed e Al sono fermamente decisi a riportare in vita la madre, che durante i terribili anni della guerra era il loro pilastro e la loro forza.
Ep. 4
Trasmutazione d'amore
Sulle tracce di un personaggio importante della loro infanzia, Ed e Al si ritrovano in una città infestata da una donna fantasma.
Ep. 5
Auto-mail a tutta forza!
Ed e Al salgono su un treno diretto a Central City e presto si trovano a dover difendere i passeggeri, compreso il generale Hakuro, dai terroristi.
Ep. 6
L'esame da alchimista di stato
Arrivati a Central City, Ed e Al si trasferiscono nel palazzo di Shou Tucker, l'Alchimista Intreccia-Vite, e iniziano a prepararsi per l'esame di alchimia.
Ep. 7
La notte del pianto della chimera
Diventato un Alchimista di Stato ufficiale, Ed esamina gli esperimenti di Tucker sulle chimere e si accorge che c'è qualcosa di inquietante.
Ep. 8
La pietra filosofale
Un disincantato Ed rinuncia alla posizione di Alchimista di Stato, mentre Winry arriva in città, rischiando di diventare la prossima vittima del serial killer.
Ep. 9
L'orologio d'argento del cane dell'esercito
Ed e Al hanno il compito di ispezionare una piccola colonia mineraria e scoprono che gli abitanti vengono pesantemente tassati da un tiranno e dal suo Alchimista.
Ep. 10
L'inafferrabile ladra Psiren
Nel tentativo di evitare un incontro con Mustang, Ed e Al finiscono in una piccola città e si trovano coinvolti nella caccia a una Robin Hood in gonnella.
Ep. 11
La città dell'oro (1ª parte)
Ed e Al si recano a Xenotime nella speranza di trovare la pietra filosofale, ma si imbattono solo in due ragazzi che stanno fabbricando una strana acqua rossa.
Ep. 12
La città dell'oro (2ª parte)
Ed e Al scoprono una cospirazione che vede implicato il padre dei fratelli Tringham, il suo coinvolgimento con l'acqua rossa e con l'epidemia che ha colpito Xenotime.
Ep. 13
Fuoco contro acciaio
Ed fa rapporto a Mustang a East City, dove le voci sul dottor Marcoh e sulla pietra filosofale portano a un duello fra Ed e il colonnello.
Ep. 14
La mano destra della distruzione
Mentre Envy si trasforma in Cornello, Ed e Al trovano Marcoh e apprendono del coinvolgimento della pietra nell'insurrezione di Ishbar.
Ep. 15
Il massacro di Ishbar
Mentre l'Alchimista Nerboruto li difende dal caos circostante, Marcoh rivela agli Elric le terribili atrocità del massacro di Ishbar.
Ep. 16
Le cose perdute
Mentre Marcoh ha un incontro fatale con Lust, Armstrong e i fratelli Elric vanno a Resembool ed Ed ha uno scatto d'ira quando perdono Al.
Ep. 17
Una casa dove la famiglia ti aspetta
Mentre si riposa a Resembool in attesa delle riparazioni, Ed visita la tomba della madre e Al si mostra molto preoccupato per i ricordi che stanno sbiadendo.
Ep. 18
Gli scritti di Marcoh
Ed e Al devono cercare un'altra biblioteca dove trovare il libro di Marcoh, dopo che Lust, Gluttony e Scar hanno bruciato e raso al suolo la First Branch Library.
Ep. 19
Gli abissi della verità
Ed e Al rimangono inorriditi quando scoprono il materiale principale della pietra filosofale, ma proseguono l'esplorazione di un laboratorio abbandonato.
Ep. 20
Le anime dei guardiani
Alcune avarie nell'armatura rendono difficile per Ed e Al il confronto con delle anime torturate collegate a corazze vuote.
Ep. 21
Bagliore rosso
Barry dà il via a una serie di esplosioni che liberano inavvertitamente Greed e gli altri prigionieri, mentre Tucker ritorna dal mondo dei morti con una nuova forma.
Ep. 22
Uomini artificiali
Assumendo le sembianze di Basque Grand, Envy raccoglie ilmateriale umano necessario a creare la pietra, mentre Maes Hughes salva ifratelli Elric dal Laboratorio 5.
Ep. 23
Cuore d'acciaio
Edward sconvolge Winry con il suo silenzio e Alphonse decide di affrontare Edward, rivolgendogli alcune domande sulle anime artificiali.
Ep. 24
Falsi ricordi
Alphonse scappa e si trova faccia a faccia con Scar, che si nasconde fra i rifugiati di Ishbar, perseguitati dai mercenari.
Ep. 25
Cerimonia d'addio
Quando Ed e Al mettono Winry sulle tracce di Scar per saperne di più sulla pietra, scoprono che esiste un legame fra il Laboratorio 5 e la guerra di Ishbar.
Ep. 26
Le sue ragioni
Quando Ed, Al e Winry arrivano a Rush Valley per recuperare gli automail, Mustang è convinto che il responsabile della morte di Hughes sia un alto ufficiale.
Ep. 27
L'insegnante
Edward e Alphonse temono per la loro vita quando si trovano davanti la loro ex insegnante, Izumi Curtis, che li riporta a Dublith.
Ep. 28
Tutto è uno. Uno è tutto
Izumi lascia Ed e Al sull'isola di Yock, dove li ha trovati la prima volta, per dare loro una lezioni di vita e invitarli a riflettere.
Ep. 29
Un bambino innocente
Edward e Alphonse scopre che il ragazzo trovato sull'isola di Yock è al tempo stesso un alchimista, un homunculus e un trasformista.
Ep. 30
Assalto al quartier generale del sud
Mentre l'esercito cattura il misterioso ragazzo dell'isola di Yock e lo mette in carcere, Yoki riesce a individuare Scar fra un gruppo di ishbaliani.
Ep. 31
Il peccato
Envy si traveste da Bradley e strappa il piccolo homunculus a Izumi. Intanto il ragazzo si ricorda del passato, dopo aver mangiato alcuni frammenti della pietra.
Ep. 32
Dante della selva oscura
Izumi combatte con Ed e Al contro Wrath, un nuovo homunculus che cerca i resti del corpo di Edward per diventare umano.
Ep. 33
La cattura di Al
Quando Martel prende l'armatura di Al e lo porta al quartier generale di Greed, tocca a Izumi ed Edward correre in suo aiuto.
Ep. 34
La teoria di Greed
Con Ed, Izumi e Sig sotto la sua custodia, il tenente colonnello Archer reintegra Shou Tucker come Alchimista di Stato e ordina ai suoi uomini di dare la caccia a Greed.
Ep. 35
Gli stolti si ritrovano
Mentre Edward e Alphonse si dirigono verso Ishbar con Winry, Lust è seduta in un ristorante dove all'improvviso entra un uomo legato al suo passato.
Ep. 36
Il peccatore che è in me
Ed e Alphonse sperano di saperne di più sulla pietra filosofale dando una mano a un gruppo di rifugiati ishbaliani inviati nel profondo sud.
Ep. 37
Il sottotenente all'attacco - Il mistero del magazzino numero 13
Mentre indaga su Mustang, il tenente Havoc ordina a Falman di trovargli una ragazza. Più tardi, Mustang si trova a indagare sul Deposito 13.
Ep. 38
Nella corrente del fiume
Dopo una violenta discussione fra Ed, Winry e Al, quest'ultimo s'imbatte in un volto familiare, mentre Winry decide di indagare sull'omicidio di Hughes con Sheska.
Ep. 39
La guerra civile dell'Est
Kimblee viene nominato Alchimista di Stato e conduce le truppe a Liore, dove Scar sta scavando con una grossa pietra.
Ep. 40
Cicatrici
Il settimo e ultimo homunculs viene finalmente rivelato a Liore, quando Lust e Gluttony intervengono in uno scontro fra Edward e Scar.
Ep. 41
Santa madre
Con l'aiuto della Santa madre Rose, Scar istruisce gli abitanti di Liore affinché evitino ogni forma di violenza in attesa dell'arrivo dei soldati in città.
Ep. 42
Senza sapere il suo nome
Con Ed impegnato a soccorrere gli abitanti di Liore, Scar è l'unico in grado di aiutare Alphonse quando la sua armatura inizia a trasformarsi in un congegno esplosivo.
Ep. 43
Il cane randagio è fuggito
Mentre i fratelli Elric fuggono da Liore, Winry incontra uno strano individuo a Resembool, che le viene poi presentato come il padre di Ed e Al.
Ep. 44
Hohenheim della luce
Mentre Hohenhelm della Luce affronta il capo degli homunculus, Lyra e Rose trovano una scala segreta all'interno di una vecchia chiesa.
Ep. 45
Ciò che fa marcire il cuore
Una storia complessa e ingarbugliata prende vita quando Van Hohenheim combatte contro Dante, leader degli Homunculus.
Ep. 46
Trasmutazione umana
I due fratelli sono in pericolo, quando vengono separati, Ed ritorna a casa di Dante in cerca di indizi e Al incontra Shou Tucker.
Ep. 47
Il sigillo dell'homunculus
Wrath è convinto che la sua vera madre sia Sloth, impegnata a combattere contro Shou. Intanto Ed si rende conto che Al è stato raggirato da Tucker.
Ep. 48
Addio
Armstrong scatena una rivolta contro il Führer al confine settentrionale, mentre Ed e Izumi sfidano gli homunculus ancora presenti a Central City.
Ep. 49
Oltre la porta
King Bradley torna a casa con un regalo per il compleanno del figlio, Edward incontra Russell in una chiesa abbandonata e Maria e Denny arrivano ad aiutare Izumi.
Ep. 50
Morte
Edward Elric si ritrova oltre il Cancello durante la Prima guerra mondiale, mentre Roy Mustang affronta Pride, l'homunculus suo nemico.
Ep. 51
Monaco di Baviera 1921
Edward Elric si rende conto di dover compiere il sacrificio supremo se vuole riportare in vita suo fratello. Invece Hawkeye riesce a sfuggire ai suoi carcerieri.
