Ep. 1
New World Map
Senku e Kohaku sorvegliano dall'alto l'area intorno al Regno della scienza in cerca di risorse per l'attraversata oceanica accompagnati da Ryusui.
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Dr. Stone: New World
Il Regno della scienza vuole risolvere finalmente il mistero della pietrificazione e si mette in mare spiegando le vele verso l'altro lato del mondo.
Ep. 1
Ep. 2
Voglio = Giusto
Ryusui resta deluso dalla pessima cucina di Senku e decide di risvegliare il suo fedele maggiordomo nonché abile cuoco Francois. Senku vuole del pane a lunga conservazione.
Ep. 3
First Contact
Senku scatta delle foto dalla mongolfiera nella speranza di trovare il petrolio, ma inutilmente. Francois e Suika usano le foto per localizzare del cibo gourmet.
Ep. 4
Gli occhi della scienza
Senku e i suoi amici si mettono al lavoro per creare un radar e un sonar nel tentativo di trovare un modo per localizzare la fonte dell'inquietante messaggio in codice Morse.
Ep. 5
La nave della Scienza, Perseus
Senku e gli abitanti del villaggio iniziano a costruire un grande veliero, ma incontrano un problema apparentemente insormontabile. Ryusui trova una soluzione intelligente.
Ep. 6
Treasure Box
La nave della scienza Perseus naviga alla ricerca della navetta spaziale Soyuz, dove Senku crede che il suo equipaggio troverà una scorta di minerali preziosi, tra cui il platino.
Ep. 7
La luce della disperazione e della speranza
Subito dopo l'arrivo sull'isola, Senku guida una piccola squadra alla ricerca di platino. Ukyo e Ginro fanno una scoperta allarmante sul fondo del mare.
Ep. 8
L'asso nella manica è sulla nave della Scienza
Senku e il resto del gruppo vengono a conoscenza dell'arma pietrificante e pensano a un piano per rubarla con tanto di Kohaku debitamente truccata.
Ep. 9
Lo splendore della scienza
Mentre gli isolani cercano la Perseus, Suika distrae Ginro per portare il laboratorio mobile dalla nave a Senku.
Ep. 10
Science Wars
Kohaku riceve istruzioni tramite un auricolare mentre il suo gruppo s'infiltra nel campo principale del nemico. Senku e gli altri costruiscono un motore elettromagnetico.
Ep. 11
Un miracolo con il mio pugno
Una sgomenta Kohaku scopre che la capsula Soyuz è bloccata nel cemento. Senku trova un modo per spaccarlo senza fare rumore.
Ep. 12
Il contrattacco del Regno della Scienza
Senku spera di rianimare Kaseki con l'acido nitrico appena ottenuto, ma gli uomini di Ibara gettano in mare i membri pietrificati dell'equipaggio e portano via Ryusui.
Ep. 13
Il vero volto di Medusa
Senku e i suoi amici rianimano Kaseki, poi si dedicano a salvare gli altri e a realizzare un drone. Nel frattempo, Ginro s'imbatte in un segreto sconvolgente.
Ep. 14
Un deal game con duello mentale
Amaryllis racconta a Senku e ai suoi amici di Ginro e Kohaku e del segreto del regno. Mentre analizzano tutti gli indizi, Moz appare all'improvviso.
Ep. 15
Battaglia decisiva in tre dimensioni
L'attacco a sorpresa di Moz semina il panico nel Regno della pietrificazione mentre Senku e gli altri costruiscono una nuova potente arma e si preparano alla battaglia finale.
Ep. 16
Battle Royale
Kinro guida la carica contro i nemici guerrieri mentre il gruppo di Ryusui attende il momento giusto per prendere il raggio pietrificante con il drone.
Ep. 17
Joker
Il gruppo di Senku s'imbarca sulla Perseus nel disperato tentativo di impedire a Ibara di pietrificare l'intera isola, ma subisce l'attacco di Moz. Senku fa una mossa rischiosa.
Ep. 18
Il brillio della rovina
Hyoga si accorge di essere in inferiorità numerica contro Moz e decide di saltare dalla barca e nuotare verso l'isola, dove la sua lancia viene potenziata.
Ep. 19
Last Man Standing
Senku riesce a evitare di essere trasformato in pietra grazie ad alcuni calcoli fatti al volo e affronta Ibara in una resa dei conti finale per il raggio pietrificante.
Ep. 20
First Dream
Senku rianima i suoi compagni. Insieme iniziano a riparare la Perseus e contattano Ruri, ma la chiamata viene interrotta da un insolito segnale.
Ep. 21
L'isola del tesoro
Prima di tornare a casa per prepararsi al viaggio sulla luna, Senku e gli altri si alleano con gli abitanti dell'isola. Soyuz prende una decisione.
Ep. 22
Beyond the New World
Senku usa l'ultimo potere del dispositivo per risvegliare Tsukasa e poi con gli altri traccia la rotta per andare a raccogliere quanto necessario per il viaggio nello spazio.
