Ep. 1
Deeks scompare durante un incarico sotto copertura per la polizia di Los Angeles; Hetty offre aiuto, quindi Callen e compagnia danno una mano; Eric segue le tracce di un cattivo serbo; Deeks si presenta e risolve il caso e la squadra lo tira fuori
Ep. 2
A Cipro, un agente dell'NCIS viene assassinato; l'assassino atterra all'aeroporto di Los Angeles, G lo cattura, lo interroga e ottiene informazioni tramite un accordo; G si infiltra nella squadra di sicari per la successiva azione letale; la squadra risolve l'enigma e cattura i criminali.
Ep. 3
Su una proprietà statale vicino a Imperial Beach, in California, a sud di San Diego, mentre quattro marine pattugliano la zona (lungo il confine tra Stati Uniti e Messico) a supporto degli agenti federali della dogana e dell'immigrazione, persone sconosciute per ragioni ignote
Ep. 4
In un parcheggio multipiano su Rodeo Drive a Beverly Hills, California, vicino a Los Angeles, due acquirenti trovano il corpo di un uomo senza una mano mozzata in modo grossolano, che è mancante; la vittima era un caporale dei Marines, di stanza a Camp Pendleton
Ep. 5
La figlia quattordicenne di un comandante della Marina viene rapita e sepolta viva. L'FBI e la sua squadra indagano su un serial killer incarcerato con un modus operandi identico. Il passato di Sam lo aiuta a immedesimarsi nella vittima.
Ep. 6
Nel centro di Los Angeles una donna armata da sola prende d'assalto una stazione di reclutamento della Marina; G la riconosce come la sua ex partner sotto copertura per la CIA; lei gli chiede aiuto e lo ottiene; la squadra trova il cattivo responsabile
Ep. 7
Due uomini, un riservista dei Marines e un chirurgo plastico, muoiono in seguito a una sparatoria, e una donna scompare; Callen e la sua squadra indagano; Eric e Nell forniscono indizi, e il team si reca a una festa, dove cattura i criminali e impedisce che causino danni.
Ep. 8
Un sergente di prima classe si congeda dall'esercito, ma il giorno stesso in cui torna alla vita civile viene rapito. Quando il suo corpo martoriato viene ritrovato, la squadra deve scoprire la causa di questa morte efferata.
Ep. 9
A Hollywood due uomini tendono un'imboscata a una limousine e sparano a morte agli occupanti; Hetty dice che il bersaglio, Renner, era un antiquario svizzero e un trafficante del mercato nero; convince il LAPD a permetterle di prendere in carico l'indagine
Ep. 10
Intrighi e violenze continuano mentre diverse fazioni sono alla ricerca del "piccolo libro nero insanguinato". La squadra indaga sulla sparatoria in cui è rimasto ucciso Cole e trova un collegamento con l'omicidio di un poliziotto avvenuto durante un controllo stradale.
Ep. 11
La squadra deve ricostruire gli eventi quando un tenente della Marina, congedato di recente e ufficiale dell'intelligence, affetto da disturbo da stress post-traumatico, assiste a una sparatoria.
Ep. 12
Mentre Rose esegue l'autopsia, due intrusi uccidono a colpi d'arma da fuoco il suo assistente e rubano il cadavere e un furgone; Rose chiama la squadra Callen, che indaga a causa di un apparente collegamento con la Marina. La squadra riesce lentamente a risolvere il mistero.
Ep. 13
Il Pentagono scopre una violazione dei dati in seguito al trasferimento online di un file contenente informazioni altamente classificate. La squadra si lancia in una corsa contro il tempo e contro altre parti interessate per individuare la fonte della fuga di dati e recuperare il file.
Ep. 14
I detenuti iniziano Moe picchiandolo all'interno di un carcere federale; Sam lo raggiunge sotto copertura; Kensi e Deeks trovano un dispositivo e un piano; Hetty dice che c'è dell'altro; avviene un'evasione, Sam perde qualcuno e un piano più ampio va avanti.
Ep. 15
Di notte, nel suo appartamento, G afferra un malintenzionato, che lavora per Arkady, che dà una mancia a G; Kensi e i suoi amici organizzano una truffa ai danni di un uomo d'affari straniero; G si ritrova in una tempesta di fuoco, ma il resto della banda si presenta e dà una mano.
Ep. 16
Callen e Sam si infiltrano come poliziotti motociclisti per indagare sulla corruzione all'interno del corpo di polizia. Quando il loro contatto viene assassinato, accettano un incarico nella speranza di catturare l'assassino.
Ep. 17
Mentre Deeks segue la sua routine mattutina, durante quella che sembra essere una rapina in un minimarket, un uomo armato gli spara due volte al petto con una pistola; Deeks viene sottoposto a intervento chirurgico; G e Sam indagano sulla scena
Ep. 18
Uno degli alias di Sam riceve un invito in Yemen per incontrare Abdul; Hetty spera che Abdul li conduca a Saadat, il fratello di Abdul, ritenuto un leader dei terroristi; G e Nate forniscono supporto; la squadra interviene e tutto si risolve per il meglio.
Ep. 19
Un bracciante latinoamericano muore e un tenente comandante dell'intelligence navale scompare; Callen e la sua squadra indagano; G e Sam trovano prove che suggeriscono un complotto per assassinare un politico venezuelano in visita
Ep. 20
Quando una struttura sicura in una base militare viene compromessa, Kensi va sotto copertura per scoprire cosa intendeva rubare il ladro di fama mondiale.
Ep. 21
Un importante dirigente del settore aerospaziale privato muore all'interno di una camera di prova nel suo stabilimento; Callen e la sua squadra indagano; Eric si infiltra come ispettore della FAA; si verifica una forte esplosione; la squadra cattura i criminali in un mercatino delle pulci.
Ep. 22
Dopo che un testimone chiave, Ray, testimonia in un processo federale per traffico d'armi, si ritira come informatore; la squadra gli assegna una nuova identità, Charlie, e lo indirizza verso una nuova località; successivamente Callen e la sua squadra rivolgono la loro attenzione ai militari scomparsi.
Ep. 23
Un uomo non identificato muore dopo essere stato picchiato e bruciato; la presenza di uno specifico radiofarmaco nel corpo suggerisce un collegamento con un caso precedente; Callen e i suoi arrestano il criminale. Hetty si dimette, scompare e riappare a Praga.
Ep. 24
Hetty si presenta a Praga e consegna un messaggio. G e Sam indagano; Eric e Nell danno una mano. G, Sam, Kensi e Deeks vanno a Praga, trovano un indizio e lo seguono fino in Romania, dove G ha un flashback e Hetty consegna il messaggio.
Un film, una serie, un attore o un doppiatore. Oppure una domanda: «chi doppia Woody?»
