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Stagione 3

La serie animata è ambientata dopo le vicende del film Madagascar 2, quindi dopo che i quattro protagonisti della serie cinematografica - Alex, Marty, Melman e Gloria - hanno deciso di rimanere per un po' in Kenya. I pinguini, prima di assaporare Monte Carlo, sono tornati a New York per un anno o di più, allo zoo di Central Park dove sono presenti anche i lemuri Re Julien, Maurice e Mortino. La presenza dei tre lemuri è dovuta al fatto che si sono fatti spedire dentro una cassa dal Kenya al Madagascar e da esso a New York (come viene fatto vedere nella sigla iniziale), e poi torneranno dopo un anno in Africa, come all'inizio del terzo film.

Stagione 1 Stagione 2 Stagione 3 Speciali

Ep. 1

Fervore felino

16 aprile 2012 12 min

Quando re Julien viene accidentalmente cacciato dal suo regno, viene scambiato per un gatto e adottato dalla vecchia signora Gladys.

Ep. 2

Sono io il re

17 aprile 2012 12 min

Kowalski usa un'invenzione per scambiare la mente di Re Julian con quella di tutti i pinguini per vincere un concorso.

Ep. 3

Miss Visone

18 aprile 2012 12 min

La pelliccia di Marlene è sbiancata quando Alice esagera con il cloro nell'habitat della lontra.

Ep. 4

Azione reazione

19 aprile 2012 12 min

Skipper viene accidentalmente cosparso di una sostanza chiamata Inflatium, per cui ogni volta che è stressato si gonfia come un palloncino.

Ep. 5

Impronte fatali

20 aprile 2012 12 min

Dopo aver capito che i pollici di Maurice potrebbero rivelarsi molto utili, i pinguini lo reclutano nella loro squadra.

Ep. 6

Operazione Pianeta Blu

22 aprile 2012 24 min

I pinguini devono affrontare una battaglia globale quando la loro speciale macchina per la produzione di cibo emette una nube tossica che minaccia non solo lo zoo, non solo la città, ma la Terra stessa!

Ep. 7

Capelli volanti

6 maggio 2012 12 min

Il parrucchino del commissario si stacca e si blocca subito sulla testa di Maurice. I pinguini, per non perdere le proprie razioni di pesce, cercano subito di recuperarlo.

Ep. 8

Amore senza ali

6 maggio 2012 12 min

Dopo che Rico ha salvato Shelly, lei si innamora di lui. Le cose diventano un po' folli quando lei rapisce la sua bambola in preda alla gelosia.

Ep. 9

Cocchi di mamma

13 maggio 2012 12 min

L'opossum Ma si stabilisce nella tana dei pinguini. Soffoca i pinguini con il suo amore e loro si trasformano in un branco di teneroni, lasciando la possibilità ad Hans di approfittarsene.