Ep. 1
Sarah chiede a Charlie di raccontarle come si sono incontrati lui e Rex. Tutto ha inizio con l'omicidio di un'agente dell'Unità cinofila durante un inseguimento. Charlie fin dall'inizio instaura un ottimo rapporto con il cane dell'agente ucciso, Rex e indaga con lui per risolvere il caso. Da quel momento i due diventano inseparabili e grazie a Rex, Charlie riuscirà a ritrovare il bambino scomparso.
Ep. 2
Un detenuto fugge durante un trasferimento. Alla ricerca di informazioni Charlie interroga la moglie dell'evaso. Lei afferma che il marito non ha commesso l'omicidio per cui è stato condannato e che lui ha la prova che lo dimostra: un video girato con il suo cellulare che riprende il vero assassino. Charlie segue le tracce del fuggitivo e si trova in una situazione critica da cui lo salverà Rex.
Ep. 3
Un gruppo di escursionisti trova un cadavere nella foresta. Si tratta di un giovane ucciso qualche mese prima da un colpo di fucile. Charlie scopre che, nell'area in cui è stato rinvenuto il corpo, vive una comunità di survivalisti e inizia le indagini. Quando entra in contatto con loro i suoi sospetti si concentrano su una persona in particolare che cercherà di ucciderlo, ma verrà fermato da Rex.
Ep. 4
Davon Rudd, subacqueo, muore a causa della scarsa fornitura di ossigeno. Charlie è chiamato ad indagare con Jesse, che è a San Diego per una conferenza tecnologica. Charlie fa alcune domande al proprietario del ristorante J&J's Marina che conferma la cena che Davon ha tenuto con una donna.
Ep. 5
Briane Peters, presidente dell'organizzazione World Healing che raccoglie fondi per acquistare farmaci, subisce un tentato avvelenamento da oppioidi mescolati nello zucchero per caffè. Per fortuna si salva. Jesse trova delle email aggressive di Dana Mulvey, medico volontario che si lamentava di mancate forniture di farmaci per lo Zimbabwe.
Ep. 6
Katie crea un memoriale nel luogo in cui l'amica è stata uccisa due anni prima. Quando la madre si allontana, viene rapita. I sospetti della polizia si focalizzano sui due sospettati dell'omicidio, ma niente li collega al rapimento.
Ep. 7
Karl Bruell è un informatore di Jo a cui da un appuntamento per dargli delle dritte. Jo lo trova gravemente ferito tanto da morire ma riesce a sussurrare una parola: "Tros". Sulla posto Rex sente un forte odore su un cumulo di immondizia che Sarah dovrà esaminare. Il sospettato è Randy Share, un contrabbandiere ora broker doganale.
Ep. 8
Charlie e Rex indagano sulla morte di Stacey, un'animatrice per bambini travestita da principessa che lavora per l'agenzia "Principesse in affitto". La morte avviene in modo sospetto alla festa di compleanno di una bambina. Dai sopralluoghi trovano un' impronta che potrebbe essere utile per l'indagine.
Ep. 9
Charlie e Rex sono vittime di un agguato. Addormentato con un dardo narcotizzante, Charlie si risveglia all'interno di una cassa, sepolto vivo. Il rapitore contatta Donovan e chiede un riscatto. Tutto sembra portare al caso di un serial killer al quale Charlie aveva collaborato cinque anni prima. Ha inizio una corsa contro il tempo per rintracciare i responsabili, prima che Charlie finisca l'aria.
Ep. 10
Un uomo salta in aria con la propria auto. La moglie non sa indicare chi possa essere il colpevole. Le indagini puntano verso un giovane piromane appena uscito di prigione, il cui modus operandi è uguale a quello.
Ep. 11
Un uomo viene ucciso. È un imprenditore che anni prima lavorava per la società che aveva tolto ai nativi i loro territori di caccia per trasformarli in un centro urbano. Il corpo ha una grossa X dipinta con della vernice rossa sulla schiena, caratteristica che rimanda a una serie di delitti avvenuti anni prima, per i quali era stato accusato un nativo, poi suicidatosi. Ma non tutto è come sembra.
Ep. 12
Charlie lascia che sia Rex a condurre le indagini quando ad una prestigiosa gara canina si verifica un omicidio.
Ep. 13
Intrappolati in una casa durante una violenta tempesta, Charlie e Rex devono scoprire un aspirante assassino dopo che la padrona di casa viene avvelenata. Tutto questo, mentre Sarah si trova a dover combattere per la propria sopravvivenza.
Ep. 14
Dopo che il migliore amico di Jesse scompare, Charlie e Rex scopriranno che l'uomo ha in realtà due vite.
Ep. 15
Quando durante uno spettacolo di magia, la maga muore Rex e Charlie dovranno condurre le immagini tra trucchi, specchi e incantesimi per scoprire la verità.
Ep. 16
Charlie e Rex sono testimoni di una rapina a mano armata in una banca. Quando cercheranno la verità scopriranno una connessione tra diverse rapine irrisolte del passato.
Un film, una serie, un attore o un doppiatore. Oppure una domanda: «chi doppia Woody?»
